首先，在仲裁诉讼中关于证据证明责任这方面，用人单位需要承担更大的责任，如果不能列举出来，那就是等于他们承认并且愿意承担这一不利的后果；第二，但凡发生诉讼案件，不管是不是劳动仲裁，现单位都需要将此进行公示；第三，一旦劳动纠纷败诉，公司就会支付一定的经济补偿金，或者赔偿金以及仲裁的相关费用；最后，整个仲裁或者诉讼过程十分复杂，一个案子可能要开好几次庭，也会增加公司人力资源部或法务部员工的工作负担。