领导既然不同意辞退，这名员工应该有他的过人之处~尝试非正常沟通（私下侧面沟通）了解其迟到早退旷工的真实原因，从根本上帮助或杜绝这种现象，如果各种办法都尝试过，还是不行，而且该员工有他存在的价值，或能够给公司创造业绩，那公司可以从制度体系上调整，如果有必要的话，有些岗位可以设置晚走晚到，或者兼职合作的形式。当然，按正常出勤工作拿的是正常的工资，如果自己不能够遵守纪律，可以和公司约定产生一定的绩效，拿到怎样的兼职工资及奖励~让员工自己选择。自己选择的，相信自己会遵守。