执业药师体检是会检查小三阳的，执业药师注册体检要求必须是县级以上（含县）疾病预防控制机构出具的健康证明，其中一项体检项目就是“乙肝两对半”检查。在进行乙肝两对半检查的时候，就包括乙肝表面抗原、乙肝e抗体还有乙肝核心抗体这三项指标的检测。 小三阳是乙肝病毒携带者的一种状态，即乙肝表面抗原、乙肝e抗体还有乙肝核心抗体这三项指标阳性。一般来说乙肝传染性比较弱，但如果乙肝病毒稀缺发生了变异传染性就会比较强。