扣税基数的设置方法如下： 1、打开T3软件； 2、打开工资管理，进入工资管理功能模块； 3、在确定打开了工资类别，设置好工资项目、人员档案，录入了工资变动数据的基础上单击“扣缴个人所得税”按钮； 4、在弹出的对话框中单击“确定”，会进入个人所得税扣缴表； 5、在个人所得税扣缴申报表页单击“税率表”小菜单； 6、在税率表中，选择“基数”对话框，将数据进行更改即可。