办税服务厅存在的困难和问题有：1、网上办税服务平台功能不够完善，无法满足纳税人办税需求。2、办税系统之间存在数据不同步、衔接不畅的问题，影响了办税效率。3、自助办税推行方面存在终端设备数量不足，且功能还不够齐全的问题。4、移动办税终端办税功能有限，导致推广面和应用面还不够广。5、缺乏统一高效的税企沟通平台。建议使用CA认证、电子签章等方式，取消部分纸质档案，启用电子档案，方便数据共享、传送和使用，减少纸质资料的移交，同时，确保网上平台功能完善的实现，以及全省通办的顺利开展。