基本审计程序的运用环节包括调查了解、初步评价、符合性测试、实质性测试和评价总结。 1、调查了解：调查的方法主要有观察、询问和检测三种方法。在调查完成以后，审计员以文字表述为主，辅以内控制度调查表和内控作业流程图，对被审计单位的内部控制现状进行较为准确和全面的描述； 2、初步评价：为了对被审计单位的内控制度进行初步评价，首先要对适用于该单位的内控制度的规范模型进行设定，设定的依据是内控的各项原则、该单位的经济业务结构及行业和单位的具体特征。然后将调查了解所得的实际内控情况与规范模型进行比较； 3、符合性测试：符合性测试是指审计人员对初步调查了解中已确定其存在且认为有必要进行测试的那部分内部控制制度所进行的实效程度的一种检测。在测试中对被审计单位内控制度的落实情况逐一加以检验，然后做出符合、不符合以及符合程度好、较好、一般、较差等的评价； 4、实质性测试：实质性测试是在符合性测试的基础上进行的，它是按照内控制度符合程度的强弱，抽取不同的样本量，然后根据样本测试结果推断、测定总体的差错率和抽样结果的可信任程度及评估对其实施审计所存在的风险程度。