我国计算机审计发展的不足之处有： 1.会计信息化整体发展的限制：计算机审计的发展一些方面是因为会计电算化的发展， 会计电算化软件的强大与通用而建立了一套完整的系统，基于这种会计信息系统，可直接利用计算机审计方法和技术进行对相关数据信息的审计，充分发挥计算机审计的优势。但是由于地区的差异，有些地区的计算机技术发展不成熟，相应的会计信息化也就发展的不成熟，这也就导致了计算机审计发展的缓慢； 2.相关计算机审计软件的发展不成熟：目前，可见的计算机审计软件可区分为两方面：一种是通用型审计软件，适用于多种审计工作；另一种是专用审计软件，适用于特定的审计任务。审计软件具有手工审计所不具备的优势，它的高效率可以提高审计效率，减少审计成本。但是由于其存储媒介的特殊性，对审计数据的查询、复核等情况仍无法完全脱离人工。这样一来，便会存在一些问题； 3.审计数据采集过程中的问题：在计算机审计过程中，审计对象主要由被审计单位提供，而在这一过程中，因为电子数据的特殊性，审计人员往往无法全程监督，这就可能会导致原始电子数据的不真实和不准确。在另一方面，电子数据有时候会由系统自动生成，那么在这一过程中就会缺乏必要的线索，这样也可能会导致审计数据的不真实和不完整； 4.计算机审计软件功能的不完善：目前所通用的审计软件主要以查询程序为主，同时为事后审计服务，而这种固定的工作方式无法使得计算机审计软件的有效性充分发挥，并且，受限于长时间的手工审计，人们还未把思维方式转换回来，因此，对计算机审计软件的开发还只停留于手工审计程序，对于计算机审计本身的分析数据功能关注较少，这在某一层面上也会限制计算机审计软件的进一步发展； 5.计算机审计人员能力及职业道德素养分布不均：现在审计已逐渐从手工审计向计算机审计转换，在这一变化过程中，对于审计人员的要求不仅仅局限于财务、经济和法律方面，在计算机专业素质方面，也有了一定的要求，但是由于计算机审计发展起步较晚，老一辈审计人员在专业知识方面知识储备足够，但是，在计算机操作方面，不能满足现在计算机审计时代所要求的程度，而新一代的审计人员缺乏审计实际操作经验，计算机能力虽较前辈们来说有所提高，但是，仍不够专业。这就使得审计人员利用计算机进行辅助审计的能力不高，从而不能快速摆脱手工审计的固有模式。