减税降费存在的困难和问题主要有： 1、政策掌握难。 自2018年起，党中央和国务院陆续出台了一系列减税政策措施，实行普惠性减税与结构性减税并举。2018年出台了降低增值税税率、增值税留抵退税试点、放宽享受减半征收企业所得税优惠的小型微利企业标准、取消委托境外研发费用加计扣除限制等一系列优惠政策；2019年又出台了小微企业普惠性税收减免、增值税税率再降低、扩大增值税进项税抵扣范围、增值税行业性加计抵减、试行增值税期末留抵退税制度等一系列优惠政策。这些政策出台密度大、文件数量多、涉及税种多，加上以前年度已施行的其他税收优惠政策，对审计人员提出了很大挑战。 2、数据分析难 相对于其他国家重大政策措施而言，税收政策涉及的企业数量、业务量和数据量比较大。“金税三期”信息系统数据量庞大、数据结构复杂、变化更新快，且审计机关熟悉金三系统和税收业务的审计人员有限，数据整理、分析工作基础较为薄弱，尚难实现“数据先行”的目标。对于一个专项审计小组，就更难凭借自身力量在现场时间内完成相关数据的采集整理、分析比对等工作，很难从海量数据中较为快速准确地锁定审计重点和疑点。 3、责任认定难 我国税收征管法规定：“纳税人依照法律、行政法规的规定办理减税、免税”，要求纳税人享受减税、免税待遇的，在减税、免税期间应当按照规定办理纳税申报。《企业所得税优惠政策事项办理办法》规定：“企业享受优惠事项采取‘自行判别、申报享受、相关资料留存备查’的办理方式”。由此可见，依据现行税收征管法规，享受减免税优惠的主体责任更多是在纳税人身上，只有在纳税人已申报享受减免税的前提下，税务机关才有受理、核准、后续管理等责任；而如果纳税人未自行主动申报享受，税务机关则不存在法定的责任和义务。 4、人才保障难 减税政策措施落实情况专项审计是一个全新的审计领域，基本上没有成熟经验可循，且近年来审计署组织大规模的税收审计也较少，因此这一领域的专业审计人员较为缺乏。而从目前已取得的审计成果来看，这一领域在政策落实跟踪审计结果公告中采用的案例较少，其他形式渠道的审计成果基本上也暂未形成，产出量跟其需要投入的审计人才、技术、时间不配比。虽然审计署要求在其它各类审计项目中都要把减税降费政策落实情况作为重要审计内容，但由于人手少任务重、统筹不到位等因素影响，也较难得到保障。