中国中医科学院培训中心颁发的证书是真的。首先是该机构合理合法的存在，中国中医科学院培训中心成立于1994年，是中国中医科学院直属的培训机构，该机构隶属于政府，主要是为了利用中医科学院的人才技术优势，推动我国中医药行业的合理健康发展，培养相关人才，所以该机构颁发的证书是合法的，能得到国家的认可，可以在官网查到证书的编号。