清理往来账的方法：一，查询所有往来明细账当前余额，包括应收应付账款、其他应收应付账款、预收预付账款、长期应收应付款、应收应付票据等，凡余额不为0者，全部登记造册；二，根据往来账余额表顺序，将每一户往来账所发生的每一笔经济业务另行登记为三栏式明细账，也可以直接用电子表输入后再打印出来；三，凡涉及外企业单位的往来账，一一做出“往来对账询证函”，用传真形式发给对方；四，凡涉及内部员工往来账，只需按当前余额以报表形式在公司宣传通告上发布，限期对账查询。