公务员系列设置副科长职务的基本是区县单位，区级单位的副科长相当单位中层管理者，县级单位的副科级基本就是某局副局长，领导班子成员了，权利自然不用说；事业编制本来就属于公益服务类单位，副科级也是单位中层，主要以服务为主；两者的晋升方面，公务员要快一些，事业单位最高到处级就到头了，到副处级也可以转身份到公务员序列，其难度较大；在工资福利奖金方面，公务员要比事业单位高一个档次，所以公务员的优势更明显一点。