不会的，这两个没有什么实际性的关联。 应届毕业生仅仅是一个身份，签订灵活就业协议是用工签订合同的一种，不会对应届毕业生身份产生什么影响，但鉴于你是应届毕业生的前提，还是找一家签订劳动合同的企业会比较好，会受到相应的保护。