水文局和水利局的区别是职责不同：水文局主要负责组织拟订水文行业管理的政策、法规，组织编制全国水文事业发展规划并监督实施；水利局主要负责会同有关部门拟订水资源中长期和年度供求计划，并监督实施。水文局的具体职责是：1、组织编制国家水文站网规划并监督实施，负责国家基本水文站网的建议与管理；2、负责国家水文大中型建设项目的立项审核；3、指导、组织实施水文水资源监测工作；4、组织实施全国地表水、地下水的水量、水质监测。