1、制度不同：编制是我国的一种人事制度，公务员是行政编制；2、经费来源不同：公务员是财政全额拨款，事业编制分三种，财政全额拨款，差额拨款，自收自支；3、身份不同：公务员是各级党政机关的在编工作人员，从上往下分为五个等级，分别是国家、省、市、县、镇，以及这些单位对应的行政机关，而事业编则一般是服务于这些单位，或者为社会提供公益事业的单位。