首先你要清楚什么是罚款、什么是扣发薪资，首先两者性质就不同，单位当然没有资格罚款，只有执法部门才有权给予处罚。但对违反公司规章制度的，是可以根据实际情况予以相应惩罚，当然处罚的形式很多，如减少奖金、取消奖金、扣发旷工迟到部分的薪资、检讨书、记过、通报批评等等，根据旷工迟到情况给公司带来的损失予以补偿、赔偿（也是多样的，是可以以薪资、奖金来抵消的）。