职工报销医药费的会计科目根据不同情况而定：1、管理行政部门发生的医药费，计入管理费用科目；2、业务部门发生的医药费，计入销售费用科目；3、生产部门发生的医药费，计入制造费用科目。职工报销医药费是指员工在工作期间受伤，需要公司进行报销的医疗费用。会计科目是对会计要素对象的具体内容进行分类核算的类目，其目的是为了连续、系统、全面地核算和监督经济活动所引起的各项会计要素的增减变化，分为注会基础性科目、注会理解性科目和注会发散性科目。