通行费根据用途计入的科目有：1、管理行政部门等发生的通行费，计入管理费用科目；2、业务部门发生的通行费，计入销售费用科目；3、生产部门发生的通行费，计入制造费用科目。通行费按照发生的部门以及发生费用支出的目的分别进行账务处理：1、属于采购部门为购进原材料而发生的，不能直接量化到具体原材料的，应当计入管理费用差旅费；2、能够直接量化到具体原材料的，则应当计入原材料的采购成本材料采购，再结转至原材料科目；3、属于销售部门为了销售货物而发生的，应当计入销售费用运输费用；4、企业日常管理部门发生的外出高速公路通行费，应当计入管理费用汽车费用进行核算。